Procedura PHREG
Analiza bayesowska
| Informacje o modelach | |
|---|---|
| Zbiór | WORK.METABRIC_CLEANED |
| Zmienna zależna | t |
| Zmienna cenzurująca | c |
| Wartości cenzurujące | 0 |
| Model | Cox |
| Rangi wiązane | BRESLOW |
| Algorytm próbkowania | ARMS |
| Wielkość wyżarzania | 1000 |
| Wielkość próbki MC | 10000 |
| Przerzedzanie | 1 |
|
Liczba obserwacji wczytanych
Liczba obserwacji użytych
|
854
854
|
|---|
| Informacje o poziomach klasyfikacji | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| Klasa | Wartość | Zmienne projektowe | ||||
| lnep_c | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | |
| 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | ||
| 2 | 0 | 0 | 1 | 0 | ||
| 3 | 0 | 0 | 0 | 1 | ||
| 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | ||
| age_c | 1 | 1 | 0 | 0 | ||
| 2 | 0 | 1 | 0 | |||
| 3 | 0 | 0 | 1 | |||
| 4 | 0 | 0 | 0 | |||
| radio_therapy | 0 | 1 | ||||
| 1 | 0 | |||||
| ts_c | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| 2 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | |
| 3 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | |
| 4 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | |
| 5 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | |
| 6 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | |
| her_status | 0 | 1 | ||||
| 1 | 0 | |||||
| Podsumowanie liczby zdarzeń i wartości ocenzurowanych | |||
|---|---|---|---|
| Suma | Wystąpienie | Ocenzurowane | Procent ocenzurowanych |
| 854 | 370 | 484 | 56.67 |
| Informacje o parametrach regresji | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| Parametr | Efekt | lnep_c | age_c | radio_therapy | ts_c | her_status |
| lnep_c0 | lnep_c | 0 | ||||
| lnep_c1 | lnep_c | 1 | ||||
| lnep_c2 | lnep_c | 2 | ||||
| lnep_c3 | lnep_c | 3 | ||||
| age_c1 | age_c | 1 | ||||
| age_c2 | age_c | 2 | ||||
| age_c3 | age_c | 3 | ||||
| radio_therapy0 | radio_therapy | 0 | ||||
| ts_c1 | ts_c | 1 | ||||
| ts_c2 | ts_c | 2 | ||||
| ts_c3 | ts_c | 3 | ||||
| ts_c4 | ts_c | 4 | ||||
| ts_c5 | ts_c | 5 | ||||
| her_status0 | her_status | 0 | ||||
| Oceny największej wiarygodności | |||||
|---|---|---|---|---|---|
| Parametr | DF | Ocena | Błąd standardowy |
Przedział ufności 95% | |
| lnep_c0 | 1 | -1.0287 | 0.3045 | -1.6255 | -0.4318 |
| lnep_c1 | 1 | -0.7467 | 0.3035 | -1.3416 | -0.1518 |
| lnep_c2 | 1 | -0.2893 | 0.3072 | -0.8913 | 0.3128 |
| lnep_c3 | 1 | 0.1706 | 0.3147 | -0.4463 | 0.7875 |
| age_c1 | 1 | -0.7491 | 0.1531 | -1.0491 | -0.4491 |
| age_c2 | 1 | -0.6992 | 0.1451 | -0.9836 | -0.4149 |
| age_c3 | 1 | -0.5708 | 0.1475 | -0.8600 | -0.2817 |
| radio_therapy0 | 1 | -0.4188 | 0.1142 | -0.6426 | -0.1950 |
| ts_c1 | 1 | -2.4443 | 1.0533 | -4.5087 | -0.3800 |
| ts_c2 | 1 | -1.5076 | 1.0465 | -3.5587 | 0.5435 |
| ts_c3 | 1 | -1.2065 | 0.3225 | -1.8386 | -0.5744 |
| ts_c4 | 1 | -0.8475 | 0.3034 | -1.4421 | -0.2529 |
| ts_c5 | 1 | -0.6481 | 0.3454 | -1.3250 | 0.0287 |
| her_status0 | 1 | -0.7174 | 0.1357 | -0.9834 | -0.4514 |
| Niezależne prawdopodobieństwo a priori rozkładu normalnego dla współczynników regresji | ||
|---|---|---|
| Parametr | Średnia | Dokładność |
| lnep_c0 | 0 | 1E-6 |
| lnep_c1 | 0 | 1E-6 |
| lnep_c2 | 0 | 1E-6 |
| lnep_c3 | 0 | 1E-6 |
| age_c1 | 0 | 1E-6 |
| age_c2 | 0 | 1E-6 |
| age_c3 | 0 | 1E-6 |
| radio_therapy0 | 0 | 1E-6 |
| ts_c1 | 0 | 1E-6 |
| ts_c2 | 0 | 1E-6 |
| ts_c3 | 0 | 1E-6 |
| ts_c4 | 0 | 1E-6 |
| ts_c5 | 0 | 1E-6 |
| her_status0 | 0 | 1E-6 |
| Początkowe wartości łańcucha | |||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Łańcuch | Ziarno | lnep_c0 | lnep_c1 | lnep_c2 | lnep_c3 | age_c1 | age_c2 | age_c3 | radio_therapy0 | ts_c1 | ts_c2 | ts_c3 | ts_c4 | ts_c5 | her_status0 |
| 1 | 123 | -1.0287 | -0.7467 | -0.2893 | 0.1706 | -0.7491 | -0.6992 | -0.5708 | -0.4188 | -2.4443 | -1.5076 | -1.2065 | -0.8475 | -0.6481 | -0.7174 |
| Statystyki dopasowania | |
|---|---|
| DIC (im mniejsze tym lepsze) | 4500.545 |
| pD (efektywna liczba parametrów) | 13.882 |
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| Podsumowania i przedziały a posteriori | |||||
|---|---|---|---|---|---|
| Parametr | N | Średnia | Odchylenie standardowe |
Przedział HPD 95% | |
| lnep_c0 | 10000 | -0.9938 | 0.3154 | -1.6048 | -0.3582 |
| lnep_c1 | 10000 | -0.7131 | 0.3150 | -1.3325 | -0.0927 |
| lnep_c2 | 10000 | -0.2588 | 0.3186 | -0.8683 | 0.3651 |
| lnep_c3 | 10000 | 0.1967 | 0.3269 | -0.4195 | 0.8673 |
| age_c1 | 10000 | -0.7515 | 0.1535 | -1.0592 | -0.4614 |
| age_c2 | 10000 | -0.7018 | 0.1473 | -0.9908 | -0.4196 |
| age_c3 | 10000 | -0.5695 | 0.1472 | -0.8582 | -0.2776 |
| radio_therapy0 | 10000 | -0.4184 | 0.1149 | -0.6479 | -0.1950 |
| ts_c1 | 10000 | -2.9791 | 1.2675 | -5.5763 | -0.7996 |
| ts_c2 | 10000 | -2.0484 | 1.2465 | -4.6173 | 0.1270 |
| ts_c3 | 10000 | -1.2046 | 0.3218 | -1.8355 | -0.5811 |
| ts_c4 | 10000 | -0.8407 | 0.3013 | -1.4186 | -0.2555 |
| ts_c5 | 10000 | -0.6586 | 0.3473 | -1.3032 | 0.0477 |
| her_status0 | 10000 | -0.7150 | 0.1355 | -0.9812 | -0.4498 |
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| Efektywne liczebności prób | |||
|---|---|---|---|
| Parametr | ESS | Czas autokorelacji |
Skuteczność |
| lnep_c0 | 461.1 | 21.6857 | 0.0461 |
| lnep_c1 | 464.8 | 21.5132 | 0.0465 |
| lnep_c2 | 484.4 | 20.6454 | 0.0484 |
| lnep_c3 | 539.2 | 18.5462 | 0.0539 |
| age_c1 | 5334.4 | 1.8746 | 0.5334 |
| age_c2 | 4868.4 | 2.0541 | 0.4868 |
| age_c3 | 5011.7 | 1.9953 | 0.5012 |
| radio_therapy0 | 7501.7 | 1.3330 | 0.7502 |
| ts_c1 | 4513.2 | 2.2157 | 0.4513 |
| ts_c2 | 6934.3 | 1.4421 | 0.6934 |
| ts_c3 | 592.7 | 16.8733 | 0.0593 |
| ts_c4 | 577.7 | 17.3097 | 0.0578 |
| ts_c5 | 745.0 | 13.4225 | 0.0745 |
| her_status0 | 7663.1 | 1.3050 | 0.7663 |
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